1、培養菌材時要細心檢查菌枝和菌棒。雜菌喜腐生生活，應選用未腐朽、無霉菌的新鮮木材培養菌棒，并盡可能縮短培養時間。如果發現菌棒上有雜菌，輕者刮掉，曬1-2日；重者廢棄。
2、檢查所用麻種。如發現感染霉菌，輕者刮去、日曬，或用75%酒精、多菌靈等局部消毒后使用。凡碰傷、霉爛的麻種都要廢棄。
3、填充物要填實，切不可留有空隙。加強溫、濕、氣的管理，控制穴內濕度，保持干燥環境，就可以減少霉菌發生。
4、天麻穴不宜過大、過深。利用菌棒數量較少的菌麻栽培、是防止雜菌感染的一種最好的栽培方法。
5、加大蜜環菌的用量。菌枝或菌種放得多，菌長得快，就能抑制其他雜菌生長。
